Zum Start des Wintersemesters 2023/24 ist Thomas Hanke zum ordentlichen Professor und zum Direktor des Seminars für Philosophische Grundfragen der Theologie an der katholisch-theologischen Fakultät der Universität Münster ernannt worden. Seit 2020 hatte er dort bereits die Lehrstuhlvertretung inne.
Im Anschluss an seine Promotion im Jahr 2011 arbeitete Thomas Hanke an einem Habilitationsprojekt an der Goethe-Universität Frankfurt und lehrte seit 2011 an der Philosophisch-Theologischen Hochschule Sankt Georgen in Frankfurt. 2014 wurde er dort zum hauptamtlichen Dozenten und 2018 zum Honorarprofessor für Philosophie ernannt. In seiner Habilitationsschrift, die 2018 vom Fachbereich „Philosophie und Geschichtswissenschaften“ der Goethe-Universität angenommen wurde, untersucht er die neopragmatistische Philosophie Robert Brandoms auf ihre metaphysischen Konsequenzen sowie auf ihre methodologischen Implikationen bezüglich des Umgangs mit Positionen aus der Philosophiegeschichte. Thomas Hanke forscht insbesondere zu Kant und Hegel und der Aktualisierung ihrer Philosophie. Zu seinen aktuellen Projekten zählt die Edition von Kants Schrift „Die Religion innerhalb der Grenzen der bloßen Vernunft“ im Rahmen der revidierten Akademie-Ausgabe der Berlin-Brandenburgischen Akademie der Wissenschaften.